Vorlesung: Computational Biology

Algebraische Methoden

Zeit und Ort:

Donnerstag, 16:00 - 17:30,

Beginn:

27. Oktober 2011 - 2. Vorlesungswoche.

Sprache:

Englisch

Empfohlene Vorkenntnisse:

Grundkenntnisse aus Diskreter Mathematik, Linearer Algebra und Analysis.

Inhalt:

• Algebraische Geometrie (Gröbnerbasen, algebraische Varietäten, Eliminationstheorie)
• Algebro-statistische Modelle (lineare und torische Modelle, Markov-Modelle, Invarianz, statistische Inferenz)
• Anwendungen: Alignment biologischer Sequenzen, Hidden-Markov-Modell.
  

Qualifikationsziele:

• Kenntnisse: Vertiefte Kenntnisse auf einem neuen Gebiet zwischen algebraischer Geometrie und Statistik.
• Fertigkeiten. Theorie geleitetes Anwenden algebro-statistischer Methoden.
• Kompetenzen: Formalisieren von Problemstellungen, Bewerten unterschiedlicher Lösungsansätze, Einsatz von Computeralgebrasystemen.
  

Literatur:

• L. Pachter, B. Sturmfels: Algebraic Statistics for Computational Biology. Cambridge Univ Press, 2004.
  

Studien/Prüfungsleistungen:

Mündliche Prüfung.